食品安全快速檢測實驗室的選址原則同一般的化學檢測實驗室相同，應建設在遠離粉塵、有害氣體、噪聲、振動等地點。電源電壓應相對穩定，有配套的上下水、電，建議選擇通風良好的房間。

根據實際開展檢測的項目需要，建議快檢室建筑面積在10平方米左右，這樣有助于根據檢測項目合理分配功能區，便于檢測室儀器設備的合理擺放和樣品流轉及空氣流通。檢測室配備溫濕度計，有條件的應配備空調和除濕機，以保證檢測室的溫度控制在（15～28）℃，濕度控制在70%以下。

室內照明采用日光燈安全照明即可，室內必須配備滅火器，以備電路故障或化學品燃燒引發明火時滅火使用。所有設備插座均應有牢固的地線裝置，以防止設備帶電導致操作人員觸電事故。如有條件， 可在地面上鋪設絕緣地板膠。

快檢室應具備檢測操作臺，操作臺上根據檢測項目、儀器設備配置以及實驗處理方法進行功能區劃分，需要將檢測儀器和前處理設備進行分區。

快檢室應具備清洗水槽和廢水排放口，以用于清洗試驗器皿，快檢室還應配備冷藏柜，以儲存試劑及檢測樣品；快檢室墻上應張貼食品安全相關法律法規、快檢室管理制度、快檢人員工作職責和操作規范，快檢室外應張貼食品安全檢測人和檢測結果的公示牌。